Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc33Q3ULW6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms