Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smu1Q3UKJ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smu1Q3UKJ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms