Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc61Q3UJV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc61Q3UJV1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms