Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms