Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc177Q3UHB8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms