Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mcrip1Q3UGS4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mcrip1Q3UGS4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms