Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc58Q3UGP9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc58Q3UGP9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms