Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph3aQ3UFY4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms