Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q3U595 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q3U595 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q3U595 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q3U595 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q3U595 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q3U595 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q3U595 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms