Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp4Q3U4B1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp4Q3U4B1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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