Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fam117bQ3U3E2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Fam117bQ3U3E2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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