Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Otud5Q3U2S4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Otud5Q3U2S4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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