Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1J4

Ddb1, DNA damage-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb1Q3U1J4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ddb1Q3U1J4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ddb1Q3U1J4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ddb1Q3U1J4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms