Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q3U1D9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3U1D9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms