Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccdc174Q3U155 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccdc174Q3U155 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms