Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Palb2Q3U0P1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Palb2Q3U0P1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms