Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Trappc9Q3U0M1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trappc9Q3U0M1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms