Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tbc1d2bQ3U0J8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tbc1d2bQ3U0J8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tbc1d2bQ3U0J8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms