Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Hace1Q3U0D9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hace1Q3U0D9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hace1Q3U0D9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms