Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZW0

Ecscr, Endothelial cell-specific chemotaxis regulator, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcscrQ3TZW0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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EcscrQ3TZW0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EcscrQ3TZW0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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EcscrQ3TZW0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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EcscrQ3TZW0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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EcscrQ3TZW0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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EcscrQ3TZW0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
EcscrQ3TZW0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms