Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lrrc28Q3TX51 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lrrc28Q3TX51 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms