Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gtf3c3Q3TMP1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms