Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hs1bp3Q3TC93 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hs1bp3Q3TC93 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hs1bp3Q3TC93 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hs1bp3Q3TC93 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms