Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trim71Q1PSW8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trim71Q1PSW8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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