Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ptchd1Q14B62 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ptchd1Q14B62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ptchd1Q14B62 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms