Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q149G0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q149G0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q149G0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q149G0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q149G0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q149G0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q149G0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q149G0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q149G0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q149G0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q149G0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q149G0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q149G0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms