Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gli2Q0VGT2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Gli2Q0VGT2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gli2Q0VGT2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms