Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc162pQ0VG85 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc162pQ0VG85 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc162pQ0VG85 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms