Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rundc1Q0VDN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rundc1Q0VDN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rundc1Q0VDN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms