Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Itgb8Q0VBD0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Itgb8Q0VBD0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms