Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spata18Q0P557 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Spata18Q0P557 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spata18Q0P557 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms