Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc21bQ0HA38 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc21bQ0HA38 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms