Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnn2Q08093 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cnn2Q08093 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms