Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ebf1Q07802 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ebf1Q07802 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms