Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CluQ06890 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CluQ06890 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CluQ06890 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CluQ06890 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CluQ06890 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CluQ06890 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms