Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox12Q04890 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox12Q04890 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox12Q04890 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms