Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GscQ02591 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GscQ02591 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GscQ02591 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GscQ02591 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GscQ02591 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GscQ02591 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GscQ02591 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GscQ02591 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GscQ02591 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GscQ02591 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms