Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pdcd1Q02242 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pdcd1Q02242 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms