Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PrkcqQ02111 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PrkcqQ02111 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms