Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxd1Q01822 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd1Q01822 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms