Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nme2Q01768 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nme2Q01768 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms