Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Grin2bQ01097 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Grin2bQ01097 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Grin2bQ01097 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms