Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pde4dQ01063 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pde4dQ01063 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4dQ01063 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pde4dQ01063 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms