Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
PrcdQ00LT2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms