Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SeleQ00690 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SeleQ00690 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SeleQ00690 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms