Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GabpaQ00422 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GabpaQ00422 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GabpaQ00422 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms