Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pou1f1Q00286 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pou1f1Q00286 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou1f1Q00286 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou1f1Q00286 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou1f1Q00286 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pou1f1Q00286 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms