Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gbp10Q000W5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gbp10Q000W5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gbp10Q000W5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms