Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VldlrP98156 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VldlrP98156 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms