Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pitx2P97474 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pitx2P97474 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms