Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Arf1P84078 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Arf1P84078 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms